“今天天气好好哦，大家都出来吧”继续橘子群岛旅行的小智一行人现在正在海上飘荡，小霞派出了自己所有的神奇宝贝，而小智则躺在小霞腿上睡觉。
“小智你看，有一个瓶子飘在海面上”小健从望远镜里看到不远处有一个瓶子飘着，很好奇里面装着什么。乘龙把瓶子叼给小智。小智看见里面装着一个纸条，上面写着一些东西，读了出来告诉大家“见到这个瓶子的人，如果你知道水晶大岩蛇这个神奇宝贝在哪里的话，请告诉我。椪柑岛的正美上”
“水晶大岩蛇？还有这种神奇宝贝嘛”小云虽然不太了解神奇宝贝，还是好奇说出自己的疑问，这种事情不太可能“大岩蛇不应该岩石系的么？应该全身都是石头吧”
“是啊，可能是哪里搞错了吧”小健也说出了心里话，这种事情的确不太可能出现。
“这个世界上会出现一些闪光神奇宝贝，会和其他神奇宝贝有所不同，当然有可能会出现。不管了，我们先去椪柑岛，看看有没有线索，可以的话我想收服它”小智决定到椪柑岛看一下再说，到现在为止，小智还没有收服过任何一只闪光精灵“乘龙找一下椪柑岛，看这瓶子很新，应该不远”
“好”这时乘龙叫了起来。
“前方有座小岛”小刚看着远方说。
“那个就是椪柑岛了”小建也看着远方的岛屿说道。
“这是什么样的岛啊”上了岛之后，小云看着琳琅满目的玻璃制品说道。
“你们知道吗？椪柑岛是以玻璃工艺品著称的哦，岛上大部分居民都是制作玻璃工艺品的师傅，所以这里观光客也特别的多”小建听到小云的问题解释道。
“我们去找信的主人吧”小智说到。
“怎么搞的，你们这家店怎么还没有关门”在到了城镇后，小智一行人就看到前方有位青年对着一个小女孩说。
“可是”小女孩也不知道要说什么。
“你们没东西可以卖，还开店干嘛，你回去跟你哥哥说，没有才华就趁早放弃吧”青年继续对着小女孩说道。
“你乱说，才没有这回事”小女孩说完就哭了。
“喂，这么大的人居然欺负小女孩”小霞看不下去了，于是上前说道。
“谁欺负她了，你们不要多管闲事”说完就走开了。
“你还好吧”小建对小女孩说道。
“没事”小女孩抬起头说道。
“小妹妹，你叫什么名字啊”小霞这时问小女孩说。
“我叫正美”
“哦，你就是椪柑岛的正美，那这封信就是你写的了”小智拿出装着信的瓶子说道。
“你们是看到这封信来的吗？你们是来告诉我水晶大岩蛇的事吗”看到那个瓶子后，正美高兴的说。
“我们也不知道水晶大岩蛇的事”小智随后说道。
“啊~”正美感觉一下子从天堂掉进地狱。
“不过我们会帮助你的，你能不能告诉一下我们关于水晶大岩蛇的事情”小智说到。
“你们进来吧”正美带着小智他们进了到店里。
“你们好，我是阿功，是这家店的主人，我妹妹给你们添麻烦了”阿功鞠躬向小智他们道歉。
“哇！这是你做的玻璃制品吗？看起来好可爱啊”小霞马上被桌上的玻璃吸引住了。
“这确实是我做的，可惜这些都是失败品，根本一点没有灵性”说完，阿功马上将他们狠狠的摔在地上。
“能告诉我们，你为什么要找水晶大岩蛇吗”小建问道。
阿攻将自己爷爷遇到水晶大岩蛇的事告诉小智，并说他也想找到灵感。
“既然你爷爷在这座岛找到水晶大岩蛇的，那么它一定还在岛上，我们仔细找找吧”小智说到。
“没有用的，我已经将整个岛翻了个面，都没有找到”阿攻摇了摇头。
有没有用，再试一次又有何妨，神奇宝贝中心在哪，我去找大木博士一趟，不一会小智回来了。
在绕过了城镇后，小智他们到达了一条小路旁。
“我们要从哪里找起呢”小霞看着四周说道。
“看我的，出来吧路卡利欧”小智这时拿出一个神奇宝贝球。
“路卡利欧利用波导寻找岛上不一样的神奇宝贝”小智打算利用路卡利欧的波导来寻找。
不一会路卡利欧就找到了指着对面那个岛
“你是说在那个岛上啊”看到路卡利欧指着对面的小岛小智说道。
“我们走吧，乘龙决定是你了”因为现在还没到退潮的时间，所以只能靠乘龙过去了。
“你们看”在上了岛后，小刚指着前面说道。
“火箭队”看到武藏被关在一个笼子里，喵喵被倒吊在一棵树上，而小次郎则是撑在一个坑上不能动，小霞非常吃惊，“你们在干什么”随后问道。
“我们本来想做陷阱抓皮卡丘”武藏怪笑着说。
“结果不小心反而自己中了陷阱”小次郎颤抖的继续说道。
“路卡利欧在哪”小智问道，路卡利欧指了指洞里。
“好美啊”进了洞后，是一汪清清的湖水，而周围散布着块块水晶，发出耀眼的光芒，看着这一美景，小霞陶醉的说。
“原来是一个长满水晶的洞穴”小建这时也说道。
“水晶大岩蛇应该在这里了”小智看到后说。
“路卡利欧下去看看”小智让路卡利欧下水看看有没有水晶大岩蛇的踪迹。
“水里有东西”这时路卡利欧跳了上来，而小建也发现水里好像有什么所以说道。
“是水晶大岩蛇”突然出来了一个东西后，阿攻在看清了它的长相后说。
“我一定要收服水晶大岩蛇，出来战斗吧铁甲贝，这可是我辛苦训练专门对付大岩蛇的”阿功跑到前面派出了铁甲贝，铁甲贝对着水晶大岩蛇使用水枪，不过几道水枪打在水晶大岩蛇身上，却什么事也没有。而就在这时，有好多水晶石头向铁甲砸来。
“那个是大岩蛇的滚石绝招”小刚看到后说道，铁甲贝直接被砸的双眼烧起蚊香来。
“好了，交给我吧，正好我也想收服他，战斗吧喷火龙”这是小智扔出神奇宝贝球并对阿功说。
“小智没想到你把喷火龙也拿过来了”小霞看到喷火龙说到。
“喷火龙火焰漩涡”喷火龙的火焰漩涡将水晶大岩蛇团团围住。
水晶大岩蛇想反抗，不过喷火龙加大力度，将水晶大岩蛇烧的全身通红，阿功看水晶大岩蛇的身体好像看到万花筒一样，瞬间明白了如何制作最好的玻璃制品。
水晶大岩蛇倒在水里，冒出一阵水蒸气，小智扔出宝贝球，收服了大岩蛇。
“谢谢各位的帮忙，这次我一定能烧出最棒的玻璃制品”阿功说到。
“没什么，你能帮我烧一个吗”小智说到。
“没问题”
不久小智离开了岛，继续旅行，他手中拿着一个皮卡丘的玻璃制品，看起来很有灵性，皮卡丘很喜欢它。
阿功送走了小智一行人，相信他以后可以把店面做的很好。小智也把路卡利欧，喷火龙和水晶大岩蛇传送给大木研究所，希望大木博士研究出水晶大岩蛇的特点，不然以后使用不出他的特点。大木博士也是非常高兴，没想到这个世界上竟然会有水晶大岩蛇，也迫不及待的研究起来。