因为并没有大规模的调动战船，所以接连等了好几天，李邦华才聚齐了此次带来的五千京卫。
他没有耽搁，立即把五十万石赈灾的粮食，分出一部分，交给了蓬莱县令张兴。就在他准备带着剩余的粮食，赶往招远县时，突然就见到了赶来的孙国桢和王承恩。
几人见礼后，李邦华问明来意，这才知道了，崇祯要他来废除登莱卫所的消息。他不敢怠慢，当即开口询问了孙国桢关于登莱卫所的情况。
孙国桢本就是登莱巡抚，对卫所的信息是了如指掌，他也没有隐瞒，一五一十地告诉了李邦华卫所的分布情况，当然那几个跟盐商有勾结的，更是着重提了一下。
李邦华听完后，这才知道，离他不远，就有一个“登州卫”，而且这个卫，不仅糜烂不堪，还是与盐商勾结最为严重的。
其实明朝末年的卫所，早就已经糜烂不堪，毫无战力。卫所将官不断侵占军户的屯田，并且私自让军户替他们耕种，以谋私利，这种事情屡见不鲜。不过这样一来，导致军户因为地位低下，而又不断参与劳役，最后全都做了逃兵。
所以李邦华收拾卫所很容易，更何况他还带上了五千京卫，他们个个都是久经训练，虽然没有上过战场，但也是一腔热血，勇猛精进，很有军人的气质。
有心算无心，总共七个千户所，前四个还没有得到消息，就被李邦华把将官给抓了起来。只有最后三个离得远的千户所，组织了少量的军户进行抵抗，可是以卫所那些陈旧的武器，哪能跟京卫最新的武器对抗，这无异于以卵击石。
碰撞没有持续多久，京卫在仅仅付出几十人受伤，无人死亡的代价下，就将剩下的三个千户所的将官也都拿下了。
接下来就是清算，李邦华按照王承恩提出的要求，把那些有问题的将官，让军户们全部指认了出来，然后就反剪了双手，让他们跪在了高高的点将台上，准备进行处置。
随着一个个将官的人头落地，军户们的怨恨，似乎消散了很多，脸色也不再那么木讷；等李邦华把粮食分到他们手中后，他们身上散发的怨气似乎更小了一些；直到卫所的屯地全部分到军户手中后，每个人的脸上才都露出了久违的笑容。
李邦华适时地宣扬了一下皇恩浩荡，告诉了军户，这都是崇祯的旨意，然后就从欢呼的军户中，选出了那些想要继续参军的，把他们一部分归入了登莱水师，而那些他比较看好的就都留了下来，暂时编到了京卫。
刚刚做完这些的第二天，天空就下起了大雨，李邦华见天公不作美，只好放缓了对灵山卫的安排。
等他收到崇祯，要求在高处设立安置营的旨意时，他正在率领士兵，帮助蓬莱县令。没有丝毫耽搁，他留下一半士兵继续帮助蓬莱县令，自己则带着另一半人，还有缴获的银子和粮食，赶去了招远县。